| ภาษา : |
|
| ชุมชนวิกิพีเดีย |คำตอบสารานุกรม |ส่งคำถาม |ความรู้คำศัพท์ |อัปโหลดความรู้ |
โดเมน |
|
โดเมนเป็นโมเลกุลทางชีวภาพที่มีโครงสร้างเฉพาะและภูมิภาคที่ทำงานอิสระโดยเฉพาะอย่างยิ่งในพื้นที่ซึ่งหมายความว่าโปรตีน ในโปรตีนทรงกลมโดเมนโครงสร้างของตัวเองมีโครงสร้างประกอบด้วยสี่เฉพาะฟังก์ชั่นขึ้นอยู่กับส่วนโปรตีนจากส่วนที่เหลือของโมเลกุล แต่กับโดเมนที่แตกต่างกันของโปรตีนในโครงสร้างทุติยภูมิที่ไม่ปกติตามลำดับสั้นเชื่อมต่อ แหล่งโปรตีนที่แตกต่างกันมักจะเกิดจากยีนที่แตกต่างกันเข้ารหัส exonsโครงสร้าง ภายในโครงสร้างของโปรตีนหน่วยพับสามที่เป็นอิสระ หลายโดเมนมักจะมีการรวมกันขององค์ประกอบโครงสร้างซุปเปอร์รองหมายถึงโปรตีนห่วงโซ่ polypeptide ขึ้นอยู่กับโครงสร้างในสองขดต่อไปพับอยู่ในหลายที่ค่อนข้างเป็นอิสระจากการชุมนุมรูปทรงกลม โดเมน (Domain โครงสร้าง) อยู่ระหว่างโครงสร้างทุติยภูมิและตติยภูมิของโครงสร้างอื่นระหว่างชั้น โดเมนที่เรียกว่าแยกออกมาอย่างเห็นได้ชัดหน่วยย่อยโปรตีนในโครงสร้างทรงกลมพื้นที่ใกล้พื้นที่ที่รู้จักกัน ห่วงโซ่ polypeptide ครั้งแรกในบางกรดอะมิโนที่อยู่ติดกับพื้นที่ที่มีโครงสร้างทุติยภูมิปกติจะเกิดขึ้นและจากนั้นรองโครงสร้าง แต่ยังมีชิ้นส่วนที่อยู่ใกล้เคียงมาชุมนุมกันเพื่อก่อโครงสร้างซุปเปอร์รองบนพื้นฐานของการพับห่วงโซ่ polypeptide โครงสร้างในระดับอุดมศึกษาที่คล้ายกับทรงกลม สำหรับขนาดใหญ่โมเลกุลโปรตีนหรือหน่วยย่อยที่มักจะตามห่วงโซ่ polypeptide ของสองคนหรือมากกว่าโครงสร้างตติยภูมิสันนิฐานความแตกต่างค่อนข้างเป็นอิสระจากโครงสร้างการเชื่อมโยงในภูมิภาคนี้ค่อนข้างอิสระโครงสร้างในระดับภูมิภาค เรียกว่าโดเมนโครงสร้าง สำหรับโมเลกุลขนาดเล็กหรือหน่วยย่อยโปรตีนโดเมนและโครงสร้างในระดับอุดมศึกษาของมันคือมักจะหมายความว่าโปรตีนเหล่านี้เป็นโดเมนเดียวหรือหน่วยย่อย โดเมนตัวเองเป็นที่ประกอบแน่น แต่โครงสร้างของความสัมพันธ์ระหว่างโดเมนและโดเมนหละหลวม โดเมนและโดเมนที่มักจะมีความยาวอยู่ระหว่างโซ่เปปไทด์ที่เชื่อมต่อกับรูปแบบบานพับภูมิภาคที่เรียกว่า โมเลกุลของโปรตีนที่แตกต่างกันในจำนวนที่แตกต่างกันของโดเมน, โปรตีนโมเลกุลเดียวกันในหลายโดเมนของที่คล้ายกันหรือแตกต่างกันมากจากแต่ละอื่น ๆ โดเมนสามัญของกรดอะมิโน 100-400, ระหว่างโดเมนขั้นต่ำเพียง 40-50 กรดอะมิโน, โดเมนที่มีขนาดใหญ่อาจจะมากกว่า 400 กรดอะมิโน ธรรมชาติ ยังเป็นที่รู้จักวิทยาการ หน่วยพับของโมเลกุลโปรตีนโมเลกุลโปรตีนขนาดใหญ่ขึ้นหรือพับสามมิติของระดับหน่วยย่อยหรือนิติบุคคลสามมิติที่ค่อนข้างอิสระ ประมงยาวพับห่วงโซ่ polypeptide เป็นขั้นตอนสุดท้ายในการเชื่อมโยงโดเมน (สมาคม) จากโมเลกุลของโปรตีนที่ใช้งานหรือหน่วยย่อย ในระดับ (มิติ) โครงสร้างของลำดับกรดอะมิโนจากบางภูมิภาคของที่อยู่ติดกันกรดอะมิโนในรูปแบบปกติโครงสร้าง (มิติ) รอง (เช่นขดเกลียวα, β-พับβ-turn และสุ่ม, ฯลฯ ) และแล้วโครงสร้างทุติยภูมิของชิ้นส่วนที่อยู่ติดกันรวมตัวกันในรูปแบบโครงสร้างซุปเปอร์รอง; บนพื้นฐานนี้ห่วงโซ่ polypeptide พับเพิ่มเติมหรือใกล้ทรงกลมสามมิติ (ระดับ) จากโครงสร้าง () โดเมน . สำหรับโปรตีนทรงกลมที่มีขนาดใหญ่ก็มักจะเป็นห่วงโซ่ polypeptide ใหญ่ของสองคนหรือมากกว่าที่ค่อนข้างอิสระมิติโครงสร้างสามมิติที่เป็นของแข็งทำจากสมาคม โดเมนโครงสร้างที่พบมากที่สุดมีประมาณ 100-200 กรดอะมิโนโดยทั่วไปอย่างน้อยที่สุด 40 กว่าสามารถมีได้ถึง 400; สำหรับโมเลกุลขนาดเล็กหรือหน่วยย่อยโปรตีน "โดเมน" และ "โครงสร้างในระดับอุดมศึกษา" มักจะเป็น แนวคิดคือว่าโปรตีนเหล่านี้เป็นส่วนหนึ่งของโมเลกุลของโดเมนเดียว (เช่นไข่ lysozyme) จากจุดทำงานของมุมมองหลายเอนไซม์เป็นโปรตีนโดเมนหลายศูนย์ที่ใช้งานอยู่ระหว่างโดเมนซึ่งจะขึ้นอยู่กับ: (1) โดยใช้วิธีการเฉพาะโดเมนง่ายในการสร้างการจัดเรียงสามมิติของศูนย์ที่ใช้งานอยู่ (2) โดเมน มักจะเป็นเพียงโซ่เปปไทด์สั้น ๆ ระหว่างการเชื่อมต่อเพื่อให้มีแนวโน้มที่จะเคลื่อนที่สัมพัทธ์ระหว่างโดเมนซึ่งจะเอื้อต่อการพื้นผิวที่ใช้งานเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันหรือความเครียดใช้ศูนย์ช่วยเหลือรวม allosteric modulators และผลกระทบ allosteric เกิดขึ้นเพื่อที่จะอำนวยความสะดวกในการทำปฏิกิริยาของเอนไซม์ ปฏิกิริยาทางเคมี การจัดหมวดหมู่ เพื่อศึกษาโครงสร้างโปรตีนของกฎหมายขั้นพื้นฐานที่คนใช้วิธีการที่แตกต่างกันจากมุมที่แตกต่างกันสำหรับการจัดหมวดหมู่เป็นที่รู้จักโปรตีนโครงสร้างบางอย่างจะขึ้นอยู่กับฟังก์ชั่นทางชีวภาพบางอย่างจะขึ้นอยู่กับโครงสร้างของตัวเอง, การรวมกันของทั้งสองร่วมกันสำหรับการจัดหมวดหมู่บางส่วน . ตัวอย่างเช่น metalloproteinases สังกะสีเป็นชนิดของตัวเร่งปฏิกิริยา peptide โซ่, เปปไทด์พันธบัตรภายใน endopeptidase เอนไซม์ย่อยสลายแม้ว่าจะเป็นสมาชิก-ครอบครัวย่อยแต่ละโครงสร้างโดยรวมของพื้นที่ที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ แต่กิจกรรมเร่งปฏิกิริยาของโครงสร้างที่คล้ายกันมากดังนั้นพวกเขาจะตกเป็นของ ในชั้นเรียนของโปรตีน แต่คนส่วนใหญ่มีความคุ้นเคยกับหรือเอ็ม Levitt และ C การจัดหมวดหมู่ Chothia ของโครงสร้างโปรตีน วิธีการนี้คือการรวมกันของโครงสร้างทุติยภูมิว่าส่วนใหญ่ของโครงสร้างของโดเมนหลักและโครงสร้างโปรตีนซึ่งแบ่งออกเป็นสี่ประเภท: α-type ชนิดβ-Type, α / β-Type และอื่น ๆ ของโครงสร้างโดเมน โครงสร้างโดเมนα-type เป็นส่วนใหญ่ตั้งขึ้นโดยเกลียวαตัวอย่างเช่นโครงสร้างของ myoglobin โครงสร้างโดเมนβ-type ถูกครอบงำด้วยการต่อต้านขนาน Bu ถูกวางพับกลับซึ่งมักจะสองห่อ Bu พับกลับมารวมกันกับแต่ละอื่น ๆ เช่นโครงสร้างเม็ดสี plastid สีฟ้า โครงสร้างโดเมนα / β-Type เป็นห่อโดยαใบหูของβ-chain ของขนานเชิงรูปแบบβ-α-βประกอบด้วยตัวอย่างเช่นฟอสเฟต isomerase triose กลูโคส isomerase ปัจจัยโดเมน, โครงสร้าง โปรตีนบางα-และต่อเนื่องรวมกันβ-รูปแบบและเป็นห่อโดยปกติเป็นส่วนหนึ่งที่ก่อให้เกิดα-เกลียวของโครงสร้างโดเมนของขนาดเล็กต่อต้านขนานกลับβ-พับซึ่งสามารถได้รับการพิจารณาให้อยู่ในประเภทที่สี่ เช่นโครงสร้าง nuclease นอกจากนี้ยังมีโปรตีนขนาดเล็กที่พวกเขาจะอุดมไปด้วยในพันธบัตรซัลไฟด์หรือโลหะไอออนในรูปแบบประเภทเฉพาะของโครงสร้างของโปรตีนเหล่านี้จะปรากฏขึ้นเพื่อขอบเขตขนาดใหญ่โดยไอออนโลหะหรือของสะพานซัลไฟด์, จึงดูเหมือนกว่าเดิม โปรตีนที่ปรากฏเป็นระเบียบ α-ขดลวด; α / β-type; เต็มβ-พับ; ประเภทม้วนแบบสุ่ม สสาร โดเมนเนมเป็นหลักรวมกันของโครงสร้างโครงสร้างตติยภูมิรองในฐานะสมาชิก โดเมนแต่ละฟังก์ชั่นตามลำดับ ตัวอย่าง มี 2 lactate dehydrogenase เป็น โดเมนเชื้อรา Phytophthora ลูกโปรตีนอกสินค้าของโดเมน (Ig) จาก 12 [VL (โซ่ภูมิภาคแสงตัวแปร), CL (โซ่ภูมิภาคแสงคงที่), VH (ภูมิภาคห่วงโซ่หนักตัวแปร) CH1 (โซ่หนักภูมิภาคคงที่ 1 ), CH2 (ภูมิภาคห่วงโซ่หนักคงที่ 2), CH3 (ภูมิภาคห่วงโซ่หนักคงที่ 3) แต่ละ 2] Ig ภูมิภาคตัวแปรที่กำหนดความจำเพาะของ Ig และคุณสมบัติทางชีวภาพอื่น ๆ เช่นภูมิคุ้มกันและข้ามรกที่มีส่วนประกอบ (หรือการดูดซับใหญ่) และอื่น ๆ ที่กำหนดโดยภูมิภาคอย่างต่อเนื่อง แบบฟอร์ม: โครงสร้างโดเมนระหว่างหละหลวมรอยแตกมักจะสร้างหรือถ้ำรอยแยกมีจำนวนมากที่ไม่มีขั้วกรดอะมิโนซึ่งเป็นสิ่งที่ไม่ชอบน้ำทำให้โมเลกุลของน้ำที่จะป้อน แต่เพื่อรองรับปัจจัยโปรตีนโซเดียมหรือสารตั้งต้นเอนไซม์ และโมเลกุลอื่น ๆ ความหมาย: เว็บไซต์ที่ใช้งานของโครงสร้างโปรตีนหรือเว็บไซต์ allosteric ตั้งอยู่ในรอยแยก ตั้งแต่การเชื่อมต่อระหว่างความยืดหยุ่นโดเมนแต่ละโดเมนสามารถเคลื่อนไหวญาติที่ค่อนข้างใหญ่แยกเปิดหรือปิดเพื่ออำนวยความสะดวกโปรตีนกับโมเลกุลอื่น ๆ , ศูนย์ที่ใช้งานของชิ้นส่วนเหล่านี้มักจะเป็นที่ ชิ้นส่วนหรือเว็บไซต์ที่มีผลผูกพัน allosteric สถานะ บางส่วนของโปรตีนทรงกลมของห่วงโซ่เปปไทด์, หรือเชื่อมโยง covalently ไปสองคนหรือมากกว่า polypeptide โซ่ในโครงสร้างอวกาศสามารถแบ่งออกเป็นโครงสร้างย่อยทรงกลมในหลาย ๆ ที่แต่ละคนของโครงสร้างทรงกลมที่เรียกว่า sub-domain . ด้วยโปรตีนระหว่างโดเมนต่างๆของห่วงโซ่เปปไทด์ที่เชื่อมโยงกับแต่ละอื่น ๆ ในขณะที่ส่วนใหญ่ของการเชื่อมโยงสองโดเมนเป็น peptide โซ่เดียวที่ควั่นเฉพาะในกรณีที่หายากจะมีกำมือของเกลียวคู่เชื่อมโยงห่วงโซ่เปปไทด์ โดเมนโครงสร้างที่แตกต่างกัน ในแผนภาพการเลี้ยวเบนรังสีเอกซ์ดึงความหนาแน่นของอิเล็กตรอนสามารถเห็นได้ชัดว่าบางส่วนของโปรตีนทรงกลมส่วนรอยแตกบางรอยแตกเหล่านี้ที่แต่ละส่วนของการเชื่อมโยงระหว่างโดเมนในขณะที่การเชื่อมโยงระหว่างโดเมนหลวม แต่พวกเขาก็ยังคงเป็นห่วงโซ่เปปไทด์เดียวกันโดยโซ่เปปไทด์และโปรตีนที่เชื่อมโยงการสื่อสารที่ไม่พันธะระหว่างหน่วยย่อยต่างๆในการรักษาโครงสร้างอาศัยที่แตกต่างกันเป็นหลัก โดเมนในพื้นที่ที่มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดในระดับโครงสร้างของกรดอะมิโนที่อยู่ติดกันกับอีกคนหนึ่งในโครงสร้างสามมิติของโดเมนนอกจากนี้ยังอยู่ใกล้เคียงกับอีกคนหนึ่งในโครงสร้างหลักของกรดอะมิโนอื่น ๆ นอกเหนือจากในแต่ละโดเมน โครงสร้างอวกาศอยู่ห่างไกลจากแต่ละอื่น ๆ แม้จะเป็นโดเมนที่ต่างกัน โปรตีนที่สมบูรณ์โดเมนหน้าที่ทางสรีรวิทยาที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดบางครั้งหลายโดเมนร่วมกันเพื่อให้บรรลุฟังก์ชั่นทางสรีรวิทยาและบางครั้งโดเมนอิสระสามารถดำเนินการฟังก์ชั่นทางสรีรวิทยา แต่โครงสร้างโดเมนที่ไม่สมบูรณ์ไม่น่าเป็นไปในการผลิตทางสรีรวิทยา ฟังก์ชัน ดังนั้นฟังก์ชั่นทางสรีรวิทยาของแหล่งโปรตีนจากโครงสร้างพื้นฐานจะต้องมีการตั้งข้อสังเกตว่าแม้ว่าการทำงานของโดเมนโปรตีนและปิด แต่โครงสร้างและหน้าที่ของโดเมนไม่ได้เป็นแนวคิดเดียวกันของโดเมน ข้อแตกต่าง Motif (มาตรฐาน) ที่เป็นโครงสร้างซุปเปอร์รองในระยะสั้นคือการรวมกันของโครงสร้างทุติยภูมิปกติ ตัวอย่างเช่นส่วนที่เป็นเกลียว - ห่วง - ใบหูพับเบต้ารวมการรวมกันในขณะที่เกลียวฝรั่งเศส อีกตัวอย่างหนึ่งคือ leucine ซิปสังกะสีลวดลายนิ้วมือเป็นเรื่องธรรมดา พวกเขาดำเนินการฟังก์ชั่นบางอย่างว่าทั้งโครงสร้างของหน่วยแม่พิมพ์ร่างกายและหน่วยงานที่จะสามารถนำมาใช้โดยตรงเป็นโครงสร้างโดเมนและอุดมศึกษาของการสร้างบล็อค บางปัจจัยโปรตีนและดีเอ็นเอที่สำคัญร่องไซต์ปกพึ่งพาบรรทัดฐานบางอย่าง โดเมน (โดเมน) คือโมเลกุลโปรตีนขนาดใหญ่ในรูปแบบของบางส่วนของโครงสร้างอวกาศสามารถระบุโซนการบีบอัดมักจะเป็นเขตการบีบอัดทรงกลมหรือเส้นใย ทั้งยังเป็นหน่วยโครงสร้างเป็นหน่วยการทำงาน พื้นที่ดังกล่าวเป็นอิมมูโนโดเมนของฟังก์ชัน เห็นได้ชัดว่าโดเมนร่างกายแม่พิมพ์และเป็นแนวคิดที่แตกต่างกัน |
| ผู้ใช้งาน ทบทวน |
|
ยังไม่มีความเห็น |
